FastQCFastQC Report
Mon 13 Sep 2021
SRR389222_sub2.fastq.gz

Summary

[OK]Basic Statistics

MeasureValue
FilenameSRR389222_sub2.fastq.gz
File typeConventional base calls
EncodingSanger / Illumina 1.9
Total Sequences120000
Sequences flagged as poor quality0
Sequence length36
%GC30

[OK]Per base sequence quality

Per base quality graph

[FAIL]Per tile sequence quality

Per tile quality graph

[OK]Per sequence quality scores

Per Sequence quality graph

[FAIL]Per base sequence content

Per base sequence content

[WARN]Per sequence GC content

Per sequence GC content graph

[OK]Per base N content

N content graph

[OK]Sequence Length Distribution

Sequence length distribution

[FAIL]Sequence Duplication Levels

Duplication level graph

[FAIL]Overrepresented sequences

SequenceCountPercentagePossible Source
AGTGTAGGTTAGTTGTTTGTTAGTGTTGTTTTTTGG84107.008333333333333No Hit
GATTTGATAAATATAGATTGGATTTATGGGGTGGAT78936.5775No Hit
AATTACCATCCACCTTATAACTACCACTATAAATCA71765.9799999999999995No Hit
TTACCAATAACTAACTAAACACACCATTAATAATCT70665.888333333333334No Hit
ATAAAACCTATCCAAACAATCTACATAACCAAACAC9410.7841666666666667No Hit
CTATAAACCATCATAACACCAATAAAACCTATCCAA7320.61No Hit
TACCAATAACTAACTAAACACACCATTAATAATCTA7190.5991666666666667No Hit
GTTGTGTTGGAGAAATAGGGTGTGGAAATTATGTTG6470.5391666666666667No Hit
CTCACAATCAAAATTAACCATCTATACAACAATATT5960.4966666666666667No Hit
GTAATTATGGTGTTGTGTTGGAGAAATAGGGTGTGG5900.49166666666666664No Hit
GTTGGAGAAATAGGGTGTGGAAATTATGTTGATTTA5890.4908333333333333No Hit
GTATGATGAAAAGTTGTAGGTATAGTAGGTAGTGTA5610.4675No Hit
GAAATAGGGTGTGGAAATTATGTTGATTTATAGTGG5280.44No Hit
GAAAAGTTGTAGGTATAGTAGGTAGTGTAGATTATT5120.4266666666666667No Hit
ATGATGAAAAGTTGTAGGTATAGTAGGTAGTGTAGA5030.41916666666666663No Hit
ATTATGGTGTTGTGTTGGAGAAATAGGGTGTGGAAA4960.41333333333333333No Hit
GTTATGATGGTTTATAGTAATTATGGTGTTGTGTTG4950.41250000000000003No Hit
TGGGGTGGATTTATGAAAAATATTGTTGTATAGATG4830.40249999999999997No Hit
CATAACCAAACACCAAAAAACAACACTAACAAACAA4660.3883333333333333No Hit
ATACAACAATATTTTTCATAAATCCACCCCATAAAT4550.37916666666666665No Hit
CTACATAACCAAACACCAAAAAACAACACTAACAAA4420.3683333333333333No Hit
CAAACAATCTACATAACCAAACACCAAAAAACAACA4340.36166666666666664No Hit
ATAATATGTTGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGG4300.35833333333333334No Hit
CTATCCAAACAATCTACATAACCAAACACCAAAAAA4280.3566666666666667No Hit
ATCCAAACAATCTACATAACCAAACACCAAAAAACA4220.3516666666666667No Hit
ATGTTGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTATAG4000.33333333333333337No Hit
ATTACCATCCACCTTATAACTACCACTATAAATCAA3990.33249999999999996No Hit
ATCATAACACCAATAAAACCTATCCAAACAATCTAC3880.3233333333333333No Hit
GTGGAAATTATGTTGATTTATAGTGGTAGTTATAAG3840.32No Hit
CATCTATACAACAATATTTTTCATAAATCCACCCCA3640.30333333333333334No Hit
AAACAATCTACATAACCAAACACCAAAAAACAACAC3620.30166666666666664No Hit
CTACACTACCTACTATACCTACAACTTTTCATCATA3510.2925No Hit
TGAAAAATATTGTTGTATAGATGGTTAATTTTGATT3500.2916666666666667No Hit
TTAACAATCCAACACATCTACTCACAATCAAAATTA3450.2875No Hit
TAATAATATGTTGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTA3430.28583333333333333No Hit
ATCAAAATTAACCATCTATACAACAATATTTTTCAT3420.28500000000000003No Hit
GTTGGATTGTTAATAATATGTTGGAATAGTATGATG3410.2841666666666667No Hit
ATAATTACTATAAACCATCATAACACCAATAAAACC3370.2808333333333333No Hit
AATAAAACCTATCCAAACAATCTACATAACCAAACA3370.2808333333333333No Hit
ATCTACATAACCAAACACCAAAAAACAACACTAACA3310.2758333333333333No Hit
TAGATTGGATTTATGGGGTGGATTTATGAAAAATAT3300.27499999999999997No Hit
ATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTATAGTAGGTAGT3250.27083333333333337No Hit
ATTTTGATTGTGAGTAGATGTGTTGGATTGTTAATA3230.26916666666666667No Hit
CTATACAACAATATTTTTCATAAATCCACCCCATAA3150.2625No Hit
GGTATAGTAGGTAGTGTAGATTATTAATGGTGTGTT3090.2575No Hit
ATAAACCATCATAACACCAATAAAACCTATCCAAAC3070.25583333333333336No Hit
ATAGATGGTTAATTTTGATTGTGAGTAGATGTGTTG3000.25No Hit
GAAAAATATTGTTGTATAGATGGTTAATTTTGATTG3000.25No Hit
ATATGTTGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTAT2970.24750000000000003No Hit
CAATCAAAATTAACCATCTATACAACAATATTTTTC2820.23500000000000001No Hit
CTATTCCAACATATTATTAACAATCCAACACATCTA2770.23083333333333333No Hit
CATAACACCAATAAAACCTATCCAAACAATCTACAT2760.22999999999999998No Hit
CTATACCTACAACTTTTCATCATACTATTCCAACAT2750.22916666666666666No Hit
GATGTGTTGGATTGTTAATAATATGTTGGAATAGTA2750.22916666666666666No Hit
GTTTGGTTATGTAGATTGTTTGGATAGGTTTTATTG2710.22583333333333336No Hit
ATAACACCAATAAAACCTATCCAAACAATCTACATA2710.22583333333333336No Hit
TGTTGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTATAGT2650.22083333333333335No Hit
TTGTGAGTAGATGTGTTGGATTGTTAATAATATGTT2620.21833333333333332No Hit
CATACTATTCCAACATATTATTAACAATCCAACACA2610.21749999999999997No Hit
GTAGATGTGTTGGATTGTTAATAATATGTTGGAATA2570.21416666666666667No Hit
CTACCTACTATACCTACAACTTTTCATCATACTATT2550.21250000000000002No Hit
GATTGTTTGGATAGGTTTTATTGGTGTTATGATGGT2520.21No Hit
TTATAGTAATTATGGTGTTGTGTTGGAGAAATAGGG2520.21No Hit
ATCTATACAACAATATTTTTCATAAATCCACCCCAT2480.20666666666666667No Hit
CAACAATATTTTTCATAAATCCACCCCATAAATCCA2470.20583333333333334No Hit
TAGTAATTATGGTGTTGTGTTGGAGAAATAGGGTGT2460.20500000000000002No Hit
TTATTAACAATCCAACACATCTACTCACAATCAAAA2460.20500000000000002No Hit
TAGATGGTTAATTTTGATTGTGAGTAGATGTGTTGG2460.20500000000000002No Hit
TTGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTATAGTAG2420.20166666666666666No Hit
TGATGAAAAGTTGTAGGTATAGTAGGTAGTGTAGAT2420.20166666666666666No Hit
ATAACCAAACACCAAAAAACAACACTAACAAACAAC2410.20083333333333334No Hit
GATTGGATTTATGGGGTGGATTTATGAAAAATATTG2390.1991666666666667No Hit
ATGAAAAGTTGTAGGTATAGTAGGTAGTGTAGATTA2380.19833333333333336No Hit
CATAATTTCCACACCCTATTTCTCCAACACAACACC2360.19666666666666666No Hit
CTATAAATCAACATAATTTCCACACCCTATTTCTCC2360.19666666666666666No Hit
ATATTATTAACAATCCAACACATCTACTCACAATCA2350.19583333333333333No Hit
TTGTTAATAATATGTTGGAATAGTATGATGAAAAGT2350.19583333333333333No Hit
ACTCACAATCAAAATTAACCATCTATACAACAATAT2340.19499999999999998No Hit
TGAAAAGTTGTAGGTATAGTAGGTAGTGTAGATTAT2320.19333333333333333No Hit
TGGTGTTGTGTTGGAGAAATAGGGTGTGGAAATTAT2310.1925No Hit
ATATTTTTCATAAATCCACCCCATAAATCCAATCTA2300.19166666666666665No Hit
GTTGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTATAGTA2290.19083333333333333No Hit
CTATTTCTCCAACACAACACCATAATTACTATAAAC2290.19083333333333333No Hit
ATCTACTCACAATCAAAATTAACCATCTATACAACA2270.18916666666666668No Hit
TTGGTGTTATGATGGTTTATAGTAATTATGGTGTTG2270.18916666666666668No Hit
ACCAATAAAACCTATCCAAACAATCTACATAACCAA2270.18916666666666668No Hit
CAATCTACATAACCAAACACCAAAAAACAACACTAA2240.18666666666666668No Hit
CTACAACTTTTCATCATACTATTCCAACATATTATT2220.185No Hit
GGTTTATAGTAATTATGGTGTTGTGTTGGAGAAATA2200.18333333333333332No Hit
CCATCATAACACCAATAAAACCTATCCAAACAATCT2180.18166666666666667No Hit
TTGTTGTATAGATGGTTAATTTTGATTGTGAGTAGA2160.18No Hit
ATTTCTCCAACACAACACCATAATTACTATAAACCA2160.18No Hit
CATATTATTAACAATCCAACACATCTACTCACAATC2150.17916666666666667No Hit
GTGTTGGATTGTTAATAATATGTTGGAATAGTATGA2120.17666666666666667No Hit
CATCTACTCACAATCAAAATTAACCATCTATACAAC2100.17500000000000002No Hit
ACAATCAAAATTAACCATCTATACAACAATATTTTT2090.17416666666666666No Hit
GTTGTAGGTATAGTAGGTAGTGTAGATTATTAATGG2090.17416666666666666No Hit
CCATAATTACTATAAACCATCATAACACCAATAAAA2090.17416666666666666No Hit
ACAATCCAACACATCTACTCACAATCAAAATTAACC2080.17333333333333334No Hit
GAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTATAGTAGGTA2070.1725No Hit
AATACCATCCACCTTATAACTACCACTATAAATCAA2060.17166666666666666No Hit
CCATCTATACAACAATATTTTTCATAAATCCACCCC2060.17166666666666666No Hit
CTAAACACACCATTAATAATCTACACTACCTACTAT2050.17083333333333334No Hit
ATAGTAGGTAGTGTAGATTATTAATGGTGTGTTTAG2030.16916666666666666No Hit
ATAATTTCCACACCCTATTTCTCCAACACAACACCA2030.16916666666666666No Hit
TACCATCCACCTTATAACTACCACTATAAATCAACA2030.16916666666666666No Hit
GGGTGTGGAAATTATGTTGATTTATAGTGGTAGTTA1980.165No Hit
GGTTTTATTGGTGTTATGATGGTTTATAGTAATTAT1970.16416666666666668No Hit
TGTGTTGGATTGTTAATAATATGTTGGAATAGTATG1960.16333333333333333No Hit
GTATAGATGGTTAATTTTGATTGTGAGTAGATGTGT1950.1625No Hit
ATACTATTCCAACATATTATTAACAATCCAACACAT1950.1625No Hit
TAATATGTTGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGT1940.16166666666666665No Hit
CCTATCCAAACAATCTACATAACCAAACACCAAAAA1930.16083333333333333No Hit
ATCCAACACATCTACTCACAATCAAAATTAACCATC1930.16083333333333333No Hit
ATTTTTCATAAATCCACCCCATAAATCCAATCTATA1910.15916666666666665No Hit
AATTATGGTGTTGTGTTGGAGAAATAGGGTGTGGAA1900.15833333333333333No Hit
CACAATCAAAATTAACCATCTATACAACAATATTTT1880.15666666666666668No Hit
TTACCATCCACCTTATAACTACCACTATAAATCAAC1850.15416666666666667No Hit
ATTAACCATCTATACAACAATATTTTTCATAAATCC1850.15416666666666667No Hit
CTACTCACAATCAAAATTAACCATCTATACAACAAT1840.15333333333333335No Hit
ATTATTAACAATCCAACACATCTACTCACAATCAAA1830.1525No Hit
AATATGTTGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTA1830.1525No Hit
TGTATAGATGGTTAATTTTGATTGTGAGTAGATGTG1820.15166666666666667No Hit
TATAAACCATCATAACACCAATAAAACCTATCCAAA1820.15166666666666667No Hit
GTTGTTTTTTGGTGTTTGGTTATGTAGATTGTTTGG1810.15083333333333332No Hit
GTTAATAATATGTTGGAATAGTATGATGAAAAGTTG1810.15083333333333332No Hit
CAAACACCAAAAAACAACACTAACAAACAACTAACC1810.15083333333333332No Hit
GTGGATTTATGAAAAATATTGTTGTATAGATGGTTA1790.14916666666666667No Hit
CAATCCAACACATCTACTCACAATCAAAATTAACCA1780.14833333333333332No Hit
GTGTTGTGTTGGAGAAATAGGGTGTGGAAATTATGT1760.14666666666666667No Hit
ATACCATCCACCTTATAACTACCACTATAAATCAAC1750.14583333333333334No Hit
ATTACTATAAACCATCATAACACCAATAAAACCTAT1740.145No Hit
CAAAATTAACCATCTATACAACAATATTTTTCATAA1730.14416666666666667No Hit
CAATAAAACCTATCCAAACAATCTACATAACCAAAC1710.14250000000000002No Hit
ATTAATAATCTACACTACCTACTATACCTACAACTT1710.14250000000000002No Hit
CCAATAAAACCTATCCAAACAATCTACATAACCAAA1700.14166666666666666No Hit
CATCATAACACCAATAAAACCTATCCAAACAATCTA1690.14083333333333334No Hit
TAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTATAGTAGGTAGTG1690.14083333333333334No Hit
TGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTATAGTAGG1690.14083333333333334No Hit
GTTTATAGTAATTATGGTGTTGTGTTGGAGAAATAG1660.13833333333333334No Hit
TAACAATCCAACACATCTACTCACAATCAAAATTAA1660.13833333333333334No Hit
ATAGGGTGTGGAAATTATGTTGATTTATAGTGGTAG1660.13833333333333334No Hit
GAGAAATAGGGTGTGGAAATTATGTTGATTTATAGT1660.13833333333333334No Hit
TTTATGAAAAATATTGTTGTATAGATGGTTAATTTT1630.13583333333333333No Hit
TGTGAGTAGATGTGTTGGATTGTTAATAATATGTTG1620.135No Hit
TTGGAGAAATAGGGTGTGGAAATTATGTTGATTTAT1620.135No Hit
GGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTATAGTAGGT1610.13416666666666666No Hit
GATGGTTAATTTTGATTGTGAGTAGATGTGTTGGAT1610.13416666666666666No Hit
CAACACAACACCATAATTACTATAAACCATCATAAC1600.13333333333333333No Hit
TTCCAACATATTATTAACAATCCAACACATCTACTC1600.13333333333333333No Hit
AATAGGGTGTGGAAATTATGTTGATTTATAGTGGTA1580.13166666666666668No Hit
GATTTATGAAAAATATTGTTGTATAGATGGTTAATT1570.13083333333333336No Hit
TGGTTAATTTTGATTGTGAGTAGATGTGTTGGATTG1560.13No Hit
CATCATACTATTCCAACATATTATTAACAATCCAAC1550.12916666666666665No Hit
TAAACCATCATAACACCAATAAAACCTATCCAAACA1540.12833333333333333No Hit
ATAATCTACACTACCTACTATACCTACAACTTTTCA1540.12833333333333333No Hit
ACATAACCAAACACCAAAAAACAACACTAACAAACA1540.12833333333333333No Hit
TTGGATTGTTAATAATATGTTGGAATAGTATGATGA1530.1275No Hit
GTAGGTAGTGTAGATTATTAATGGTGTGTTTAGTTA1530.1275No Hit
GGGGTGGATTTATGAAAAATATTGTTGTATAGATGG1520.12666666666666665No Hit
ATTAACAATCCAACACATCTACTCACAATCAAAATT1490.12416666666666668No Hit
TGTAGATTGTTTGGATAGGTTTTATTGGTGTTATGA1480.12333333333333332No Hit
TAATTTCCACACCCTATTTCTCCAACACAACACCAT1480.12333333333333332No Hit
TTAACCATCTATACAACAATATTTTTCATAAATCCA1480.12333333333333332No Hit
GATGAAAAGTTGTAGGTATAGTAGGTAGTGTAGATT1470.1225No Hit
GTTGTTTGTTAGTGTTGTTTTTTGGTGTTTGGTTAT1460.12166666666666667No Hit
GGTTAATTTTGATTGTGAGTAGATGTGTTGGATTGT1460.12166666666666667No Hit
AATAATATGTTGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAG1460.12166666666666667No Hit
TTTATTGGTGTTATGATGGTTTATAGTAATTATGGT1460.12166666666666667No Hit
CACCCTATTTCTCCAACACAACACCATAATTACTAT1450.12083333333333333No Hit
TCATAACACCAATAAAACCTATCCAAACAATCTACA1450.12083333333333333No Hit
TAACACCAATAAAACCTATCCAAACAATCTACATAA1410.11750000000000001No Hit
TATTGTTGTATAGATGGTTAATTTTGATTGTGAGTA1410.11750000000000001No Hit
GTGTTGTTTTTTGGTGTTTGGTTATGTAGATTGTTT1410.11750000000000001No Hit
CAACATATTATTAACAATCCAACACATCTACTCACA1410.11750000000000001No Hit
AGGTATAGTAGGTAGTGTAGATTATTAATGGTGTGT1410.11750000000000001No Hit
TATGTTGGAATAGTATGATGAAAAGTTGTAGGTATA1400.11666666666666668No Hit
CTTTTCATCATACTATTCCAACATATTATTAACAAT1390.11583333333333333No Hit
CTACCACTATAAATCAACATAATTTCCACACCCTAT1380.11499999999999999No Hit
TATTATTAACAATCCAACACATCTACTCACAATCAA1380.11499999999999999No Hit
ACTATAAATCAACATAATTTCCACACCCTATTTCTC1370.11416666666666667No Hit
TGGAGAAATAGGGTGTGGAAATTATGTTGATTTATA1370.11416666666666667No Hit
GAGTAGATGTGTTGGATTGTTAATAATATGTTGGAA1360.11333333333333334No Hit
GATAGGTTTTATTGGTGTTATGATGGTTTATAGTAA1350.11249999999999999No Hit
CTACTATACCTACAACTTTTCATCATACTATTCCAA1350.11249999999999999No Hit
AACACATCTACTCACAATCAAAATTAACCATCTATA1330.11083333333333334No Hit
CACTACCTACTATACCTACAACTTTTCATCATACTA1330.11083333333333334No Hit
TTGGATTTATGGGGTGGATTTATGAAAAATATTGTT1330.11083333333333334No Hit
AAATTAACCATCTATACAACAATATTTTTCATAAAT1330.11083333333333334No Hit
TAAAACCTATCCAAACAATCTACATAACCAAACACC1320.11No Hit
TGTGTTGGAGAAATAGGGTGTGGAAATTATGTTGAT1320.11No Hit
CATAAATCCACCCCATAAATCCAATCTATATTTATC1310.10916666666666666No Hit
CCTTATAACTACCACTATAAATCAACATAATTTCCA1310.10916666666666666No Hit
TGGTTTATAGTAATTATGGTGTTGTGTTGGAGAAAT1300.10833333333333332No Hit
TACAACAATATTTTTCATAAATCCACCCCATAAATC1300.10833333333333332No Hit
ACCATAATTACTATAAACCATCATAACACCAATAAA1290.1075No Hit
TGTTAATAATATGTTGGAATAGTATGATGAAAAGTT1290.1075No Hit
CATAATTACTATAAACCATCATAACACCAATAAAAC1290.1075No Hit
ATCATACTATTCCAACATATTATTAACAATCCAACA1290.1075No Hit
TAGGGTGTGGAAATTATGTTGATTTATAGTGGTAGT1280.10666666666666667No Hit
ATTGTTGTATAGATGGTTAATTTTGATTGTGAGTAG1270.10583333333333335No Hit
ACACAACACCATAATTACTATAAACCATCATAACAC1270.10583333333333335No Hit
ATTTGATAAATATAGATTGGATTTATGGGGTGGATT1270.10583333333333335No Hit
TATGAAAAATATTGTTGTATAGATGGTTAATTTTGA1270.10583333333333335No Hit
CTTATAACTACCACTATAAATCAACATAATTTCCAC1270.10583333333333335No Hit
TCCAAACAATCTACATAACCAAACACCAAAAAACAA1260.105No Hit
TATGTAGATTGTTTGGATAGGTTTTATTGGTGTTAT1250.10416666666666667No Hit
GATTGTTAATAATATGTTGGAATAGTATGATGAAAA1240.10333333333333333No Hit
GGTGTTGTGTTGGAGAAATAGGGTGTGGAAATTATG1240.10333333333333333No Hit
AATCAAAATTAACCATCTATACAACAATATTTTTCA1240.10333333333333333No Hit
ATGAAAAATATTGTTGTATAGATGGTTAATTTTGAT1230.10250000000000001No Hit
GTGTTGGAGAAATAGGGTGTGGAAATTATGTTGATT1230.10250000000000001No Hit
CACAACACCATAATTACTATAAACCATCATAACACC1230.10250000000000001No Hit
GTTTGATAAATATAGATTGGATTTATGGGGTGGATT1220.10166666666666666No Hit

[OK]Adapter Content

Adapter graph

Produced by FastQC (version 0.11.9)