tissue CD8 Naive Primary Cells

Return to main page H3K27a­c H3K27me3 H3K36me3 H3K4me1 H3K4me3 H3K­9ac H3K9me3 MRE Seq MeDIP Seq mRN­A Seq smR­NA Seq BI BI UCS­F UBC BI UCS­F UBC BI UCS­F UBC BI UCSF UBC UCS­F UBC BI UCS­F UBC UCSF UBC UCSF UBC UCS­F UBC UCS­F UBC Don­or 10.­.. Don­or 10.­.. Don­or 10.­.. Don­or 10.­.. TC0­01.­.. Don­or 10.­.. Don­or 10.­.. TC0­01.­.. Don­or 10.­.. Don­or 10.­.. TC0­01.­.. Don­or 10.­.. Don­or 10.­.. TC0­01.­.. TC0­10.­.. TC0­01.­.. Don­or 10.­.. Don­or 10.­.. TC0­01.­.. TC0­03.­.. TC0­07.­.. TC0­09.­.. TC0­03.­.. TC0­07.­.. TC0­09.­.. TC0­14.­.. TC0­14.­.. H3K27ac; BI; Donor_100_7_pooled_leukopaks_Jan_7_2011 H3K27ac; BI; Donor_101_8_pooled_leukopaks_Jan_20_2011 H3K27me3; BI; Donor_100_7_pooled_leukopaks_Jan_7_2011 H3K27me3; BI; Donor_101_8_pooled_leukopaks_Jan_20_2011 H3K27me3; UCSF_UBC; TC001 H3K36me3; BI; Donor_100_7_pooled_leukopaks_Jan_7_2011 H3K36me3; BI; Donor_101_8_pooled_leukopaks_Jan_20_2011 H3K36me3; UCSF_UBC; TC001 H3K4me1; BI; Donor_100_7_pooled_leukopaks_Jan_7_2011 H3K4me1; BI; Donor_101_8_pooled_leukopaks_Jan_20_2011 H3K4me1; UCSF_UBC; TC001 H3K4me3; BI; Donor_100_7_pooled_leukopaks_Jan_7_2011 H3K4me3; BI; Donor_101_8_pooled_leukopaks_Jan_20_2011 H3K4me3; UCSF_UBC; TC001 H3K4me3; UCSF_UBC; TC010 H3K9ac; UCSF_UBC; TC001 H3K9me3; BI; Donor_100_7_pooled_leukopaks_Jan_7_2011 H3K9me3; BI; Donor_101_8_pooled_leukopaks_Jan_20_2011 H3K9me3; UCSF_UBC; TC001 MRE_Seq; UCSF_UBC; TC003 MRE_Seq; UCSF_UBC; TC007 MRE_Seq; UCSF_UBC; TC009 MeDIP_Seq; UCSF_UBC; TC003 MeDIP_Seq; UCSF_UBC; TC007 MeDIP_Seq; UCSF_UBC; TC009 mRNA_Seq; UCSF_UBC; TC014 smRNA_Seq; UCSF_UBC; TC014 0.6122 ≈0 0.1835 ≈0 0.1812 ≈0 0.0113 2.22e-01 0.2802 ≈0 0.2874 ≈0 0.1363 ≈0 0.4580 ≈0 0.4502 ≈0 0.3788 ≈0 0.5652 ≈0 0.5759 ≈0 0.4665 ≈0 0.4978 ≈0 0.4697 ≈0 0.2360 ≈0 0.2703 ≈0 0.1025 ≈0 0.2811 ≈0 0.2543 ≈0 0.2648 ≈0 -0.1253 ≈0 -0.1186 ≈0 -0.1197 ≈0 0.0847 ≈0 0.1545 ≈0 0.6122 ≈0 0.1772 ≈0 0.1769 ≈0 0.0014 3.49e-07 0.2821 ≈0 0.2915 ≈0 0.1359 ≈0 0.4776 ≈0 0.4739 ≈0 0.3934 ≈0 0.5756 ≈0 0.5876 ≈0 0.4714 ≈0 0.5056 ≈0 0.4809 ≈0 0.2305 ≈0 0.2684 ≈0 0.0974 ≈0 0.2758 ≈0 0.2471 ≈0 0.2594 ≈0 -0.1371 ≈0 -0.1292 ≈0 -0.1326 ≈0 0.0875 ≈0 0.1537 ≈0 0.1835 ≈0 0.1772 ≈0 0.5470 ≈0 0.4748 ≈0 0.1685 ≈0 0.1643 ≈0 0.1109 ≈0 0.2300 ≈0 0.2159 ≈0 0.1354 ≈0 0.2339 ≈0 0.2342 ≈0 0.1131 ≈0 0.1369 ≈0 0.1139 ≈0 0.2579 ≈0 0.2903 ≈0 0.0948 ≈0 0.0986 ≈0 0.0936 ≈0 0.0974 ≈0 -0.0992 ≈0 -0.1009 ≈0 -0.0733 ≈0 -0.1004 ≈0 0.0037 8.18e-01 0.1812 ≈0 0.1769 ≈0 0.5470 ≈0 0.4598 ≈0 0.1594 ≈0 0.1583 ≈0 0.1028 ≈0 0.2309 ≈0 0.2209 ≈0 0.1381 ≈0 0.2305 ≈0 0.2348 ≈0 0.1165 ≈0 0.1367 ≈0 0.1187 ≈0 0.2394 ≈0 0.2723 ≈0 0.0832 ≈0 0.1138 ≈0 0.1071 ≈0 0.1116 ≈0 -0.0926 ≈0 -0.0947 ≈0 -0.0734 ≈0 -0.0940 ≈0 0.0085 1.03e-01 0.0113 2.22e-01 0.0014 3.49e-07 0.4748 ≈0 0.4598 ≈0 -0.0442 2.47e-06 -0.0498 1.82e-08 0.0550 ≈0 0.0307 3.67e-12 0.0250 6.37e-05 0.0003 2.42e-01 0.0686 ≈0 0.0772 ≈0 0.0340 1.32e-06 0.0461 3.65e-14 -0.0086 3.94e-10 0.1330 ≈0 0.1495 ≈0 0.1372 ≈0 0.1032 ≈0 0.0960 ≈0 0.1010 ≈0 -0.0474 ≈0 -0.0490 ≈0 -0.0336 ≈0 -0.1584 ≈0 -0.0233 8.38e-29 0.2802 ≈0 0.2821 ≈0 0.1685 ≈0 0.1594 ≈0 -0.0442 2.47e-06 0.5978 ≈0 0.4809 ≈0 0.3042 ≈0 0.2840 ≈0 0.2345 ≈0 0.2873 ≈0 0.2618 ≈0 0.1563 ≈0 0.1923 ≈0 0.2156 ≈0 0.3454 ≈0 0.3825 ≈0 0.1769 ≈0 -0.0366 ≈0 -0.0295 ≈0 -0.0290 ≈0 -0.0651 ≈0 -0.0657 ≈0 -0.0276 ≈0 0.2577 ≈0 0.0294 1.34e-17 0.2874 ≈0 0.2915 ≈0 0.1643 ≈0 0.1583 ≈0 -0.0498 1.82e-08 0.5978 ≈0 0.4830 ≈0 0.3109 ≈0 0.2939 ≈0 0.2405 ≈0 0.2930 ≈0 0.2738 ≈0 0.1658 ≈0 0.2009 ≈0 0.2240 ≈0 0.3319 ≈0 0.3701 ≈0 0.1629 ≈0 -0.0194 7.75e-21 -0.0136 5.76e-14 -0.0138 3.15e-15 -0.0538 ≈0 -0.0541 ≈0 -0.0216 ≈0 0.2715 ≈0 0.0339 1.36e-27 0.1363 ≈0 0.1359 ≈0 0.1109 ≈0 0.1028 ≈0 0.0550 ≈0 0.4809 ≈0 0.4830 ≈0 0.1373 ≈0 0.1274 ≈0 0.1176 ≈0 0.1549 ≈0 0.1273 ≈0 0.1076 ≈0 0.1150 ≈0 0.1273 ≈0 0.3083 ≈0 0.3474 ≈0 0.3086 ≈0 -0.0610 ≈0 -0.0522 ≈0 -0.0526 ≈0 -0.0833 ≈0 -0.0788 ≈0 -0.0503 ≈0 0.2417 ≈0 0.0009 5.85e-02 0.4580 ≈0 0.4776 ≈0 0.2300 ≈0 0.2309 ≈0 0.0307 3.67e-12 0.3042 ≈0 0.3109 ≈0 0.1373 ≈0 0.6965 ≈0 0.6342 ≈0 0.5164 ≈0 0.5223 ≈0 0.3142 ≈0 0.3888 ≈0 0.3788 ≈0 0.2692 ≈0 0.2985 ≈0 0.1001 ≈0 0.2564 ≈0 0.2271 ≈0 0.2404 ≈0 -0.0877 ≈0 -0.0884 ≈0 -0.0856 ≈0 0.0852 ≈0 0.0873 ≈0 0.4502 ≈0 0.4739 ≈0 0.2159 ≈0 0.2209 ≈0 0.0250 6.37e-05 0.2840 ≈0 0.2939 ≈0 0.1274 ≈0 0.6965 ≈0 0.6226 ≈0 0.5028 ≈0 0.5125 ≈0 0.3136 ≈0 0.3791 ≈0 0.3798 ≈0 0.2425 ≈0 0.2761 ≈0 0.0881 ≈0 0.2594 ≈0 0.2304 ≈0 0.2451 ≈0 -0.0978 ≈0 -0.0958 ≈0 -0.0997 ≈0 0.0853 ≈0 0.0857 ≈0 0.3788 ≈0 0.3934 ≈0 0.1354 ≈0 0.1381 ≈0 0.0003 2.42e-01 0.2345 ≈0 0.2405 ≈0 0.1176 ≈0 0.6342 ≈0 0.6226 ≈0 0.4542 ≈0 0.4645 ≈0 0.2967 ≈0 0.3950 ≈0 0.3540 ≈0 0.2054 ≈0 0.2123 ≈0 0.1115 ≈0 0.2976 ≈0 0.2624 ≈0 0.2763 ≈0 0.0159 8.84e-04 0.0059 4.23e-01 0.0062 7.23e-02 0.1185 ≈0 0.0929 ≈0 0.5652 ≈0 0.5756 ≈0 0.2339 ≈0 0.2305 ≈0 0.0686 ≈0 0.2873 ≈0 0.2930 ≈0 0.1549 ≈0 0.5164 ≈0 0.5028 ≈0 0.4542 ≈0 0.6626 ≈0 0.4961 ≈0 0.5559 ≈0 0.4580 ≈0 0.3224 ≈0 0.3548 ≈0 0.1936 ≈0 0.3570 ≈0 0.3217 ≈0 0.3358 ≈0 -0.1224 ≈0 -0.1198 ≈0 -0.1211 ≈0 0.0699 ≈0 0.1497 ≈0 0.5759 ≈0 0.5876 ≈0 0.2342 ≈0 0.2348 ≈0 0.0772 ≈0 0.2618 ≈0 0.2738 ≈0 0.1273 ≈0 0.5223 ≈0 0.5125 ≈0 0.4645 ≈0 0.6626 ≈0 0.5177 ≈0 0.5873 ≈0 0.4666 ≈0 0.2830 ≈0 0.3133 ≈0 0.1549 ≈0 0.4183 ≈0 0.3791 ≈0 0.3939 ≈0 -0.1036 ≈0 -0.1015 ≈0 -0.1098 ≈0 0.0646 ≈0 0.1591 ≈0 0.4665 ≈0 0.4714 ≈0 0.1131 ≈0 0.1165 ≈0 0.0340 1.32e-06 0.1563 ≈0 0.1658 ≈0 0.1076 ≈0 0.3142 ≈0 0.3136 ≈0 0.2967 ≈0 0.4961 ≈0 0.5177 ≈0 0.5075 ≈0 0.4381 ≈0 0.1477 ≈0 0.1705 ≈0 0.1180 ≈0 0.3444 ≈0 0.3135 ≈0 0.3256 ≈0 -0.1035 ≈0 -0.0943 ≈0 -0.1057 ≈0 0.0760 ≈0 0.1478 ≈0 0.4978 ≈0 0.5056 ≈0 0.1369 ≈0 0.1367 ≈0 0.0461 3.65e-14 0.1923 ≈0 0.2009 ≈0 0.1150 ≈0 0.3888 ≈0 0.3791 ≈0 0.3950 ≈0 0.5559 ≈0 0.5873 ≈0 0.5075 ≈0 0.4479 ≈0 0.1946 ≈0 0.2076 ≈0 0.1343 ≈0 0.3910 ≈0 0.3518 ≈0 0.3668 ≈0 -0.0370 ≈0 -0.0390 ≈0 -0.0393 ≈0 0.0888 ≈0 0.1602 ≈0 0.4697 ≈0 0.4809 ≈0 0.1139 ≈0 0.1187 ≈0 -0.0086 3.94e-10 0.2156 ≈0 0.2240 ≈0 0.1273 ≈0 0.3788 ≈0 0.3798 ≈0 0.3540 ≈0 0.4580 ≈0 0.4666 ≈0 0.4381 ≈0 0.4479 ≈0 0.1375 ≈0 0.1629 ≈0 0.0648 ≈0 0.2719 ≈0 0.2461 ≈0 0.2566 ≈0 -0.1049 ≈0 -0.0966 ≈0 -0.0973 ≈0 0.1080 ≈0 0.1367 ≈0 0.2360 ≈0 0.2305 ≈0 0.2579 ≈0 0.2394 ≈0 0.1330 ≈0 0.3454 ≈0 0.3319 ≈0 0.3083 ≈0 0.2692 ≈0 0.2425 ≈0 0.2054 ≈0 0.3224 ≈0 0.2830 ≈0 0.1477 ≈0 0.1946 ≈0 0.1375 ≈0 0.6009 ≈0 0.4675 ≈0 -0.0172 7.47e-20 -0.0154 4.89e-12 -0.0132 2.30e-16 -0.1127 ≈0 -0.1193 ≈0 -0.0830 ≈0 0.0252 1.22e-07 0.0140 2.00e-05 0.2703 ≈0 0.2684 ≈0 0.2903 ≈0 0.2723 ≈0 0.1495 ≈0 0.3825 ≈0 0.3701 ≈0 0.3474 ≈0 0.2985 ≈0 0.2761 ≈0 0.2123 ≈0 0.3548 ≈0 0.3133 ≈0 0.1705 ≈0 0.2076 ≈0 0.1629 ≈0 0.6009 ≈0 0.5116 ≈0 -0.0326 ≈0 -0.0290 ≈0 -0.0263 ≈0 -0.1760 ≈0 -0.1774 ≈0 -0.1411 ≈0 0.0229 6.25e-07 0.0108 3.66e-03 0.1025 ≈0 0.0974 ≈0 0.0948 ≈0 0.0832 ≈0 0.1372 ≈0 0.1769 ≈0 0.1629 ≈0 0.3086 ≈0 0.1001 ≈0 0.0881 ≈0 0.1115 ≈0 0.1936 ≈0 0.1549 ≈0 0.1180 ≈0 0.1343 ≈0 0.0648 ≈0 0.4675 ≈0 0.5116 ≈0 -0.0261 6.93e-39 -0.0255 1.23e-41 -0.0233 1.13e-35 -0.1017 ≈0 -0.1020 ≈0 -0.0893 ≈0 0.0134 1.83e-02 0.0011 9.88e-01 0.2811 ≈0 0.2758 ≈0 0.0986 ≈0 0.1138 ≈0 0.1032 ≈0 -0.0366 ≈0 -0.0194 7.75e-21 -0.0610 ≈0 0.2564 ≈0 0.2594 ≈0 0.2976 ≈0 0.3570 ≈0 0.4183 ≈0 0.3444 ≈0 0.3910 ≈0 0.2719 ≈0 -0.0172 7.47e-20 -0.0326 ≈0 -0.0261 6.93e-39 0.7709 ≈0 0.8439 ≈0 0.0560 5.90e-38 0.0569 2.46e-39 -0.0035 1.05e-02 0.0628 ≈0 0.1520 ≈0 0.2543 ≈0 0.2471 ≈0 0.0936 ≈0 0.1071 ≈0 0.0960 ≈0 -0.0295 ≈0 -0.0136 5.76e-14 -0.0522 ≈0 0.2271 ≈0 0.2304 ≈0 0.2624 ≈0 0.3217 ≈0 0.3791 ≈0 0.3135 ≈0 0.3518 ≈0 0.2461 ≈0 -0.0154 4.89e-12 -0.0290 ≈0 -0.0255 1.23e-41 0.7709 ≈0 0.7402 ≈0 0.0507 3.55e-37 0.0520 2.79e-40 -0.0031 8.97e-01 0.0579 ≈0 0.1440 ≈0 0.2648 ≈0 0.2594 ≈0 0.0974 ≈0 0.1116 ≈0 0.1010 ≈0 -0.0290 ≈0 -0.0138 3.15e-15 -0.0526 ≈0 0.2404 ≈0 0.2451 ≈0 0.2763 ≈0 0.3358 ≈0 0.3939 ≈0 0.3256 ≈0 0.3668 ≈0 0.2566 ≈0 -0.0132 2.30e-16 -0.0263 ≈0 -0.0233 1.13e-35 0.8439 ≈0 0.7402 ≈0 0.0452 2.74e-25 0.0473 2.23e-35 -0.0085 1.27e-03 0.0592 ≈0 0.1479 ≈0 -0.1253 ≈0 -0.1371 ≈0 -0.0992 ≈0 -0.0926 ≈0 -0.0474 ≈0 -0.0651 ≈0 -0.0538 ≈0 -0.0833 ≈0 -0.0877 ≈0 -0.0978 ≈0 0.0159 8.84e-04 -0.1224 ≈0 -0.1036 ≈0 -0.1035 ≈0 -0.0370 ≈0 -0.1049 ≈0 -0.1127 ≈0 -0.1760 ≈0 -0.1017 ≈0 0.0560 5.90e-38 0.0507 3.55e-37 0.0452 2.74e-25 0.9378 ≈0 0.9029 ≈0 0.0846 ≈0 0.0088 1.42e-04 -0.1186 ≈0 -0.1292 ≈0 -0.1009 ≈0 -0.0947 ≈0 -0.0490 ≈0 -0.0657 ≈0 -0.0541 ≈0 -0.0788 ≈0 -0.0884 ≈0 -0.0958 ≈0 0.0059 4.23e-01 -0.1198 ≈0 -0.1015 ≈0 -0.0943 ≈0 -0.0390 ≈0 -0.0966 ≈0 -0.1193 ≈0 -0.1774 ≈0 -0.1020 ≈0 0.0569 2.46e-39 0.0520 2.79e-40 0.0473 2.23e-35 0.9378 ≈0 0.8954 ≈0 0.0870 ≈0 0.0091 4.55e-04 -0.1197 ≈0 -0.1326 ≈0 -0.0733 ≈0 -0.0734 ≈0 -0.0336 ≈0 -0.0276 ≈0 -0.0216 ≈0 -0.0503 ≈0 -0.0856 ≈0 -0.0997 ≈0 0.0062 7.23e-02 -0.1211 ≈0 -0.1098 ≈0 -0.1057 ≈0 -0.0393 ≈0 -0.0973 ≈0 -0.0830 ≈0 -0.1411 ≈0 -0.0893 ≈0 -0.0035 1.05e-02 -0.0031 8.97e-01 -0.0085 1.27e-03 0.9029 ≈0 0.8954 ≈0 0.0705 ≈0 -0.0115 6.88e-05 0.0847 ≈0 0.0875 ≈0 -0.1004 ≈0 -0.0940 ≈0 -0.1584 ≈0 0.2577 ≈0 0.2715 ≈0 0.2417 ≈0 0.0852 ≈0 0.0853 ≈0 0.1185 ≈0 0.0699 ≈0 0.0646 ≈0 0.0760 ≈0 0.0888 ≈0 0.1080 ≈0 0.0252 1.22e-07 0.0229 6.25e-07 0.0134 1.83e-02 0.0628 ≈0 0.0579 ≈0 0.0592 ≈0 0.0846 ≈0 0.0870 ≈0 0.0705 ≈0 0.0716 ≈0 0.1545 ≈0 0.1537 ≈0 0.0037 8.18e-01 0.0085 1.03e-01 -0.0233 8.38e-29 0.0294 1.34e-17 0.0339 1.36e-27 0.0009 5.85e-02 0.0873 ≈0 0.0857 ≈0 0.0929 ≈0 0.1497 ≈0 0.1591 ≈0 0.1478 ≈0 0.1602 ≈0 0.1367 ≈0 0.0140 2.00e-05 0.0108 3.66e-03 0.0011 9.88e-01 0.1520 ≈0 0.1440 ≈0 0.1479 ≈0 0.0088 1.42e-04 0.0091 4.55e-04 -0.0115 6.88e-05 0.0716 ≈0

X Color code Background total Foreground total show chrom show replicas Statistics Parameters Statistics Total Chrom Correlation 0.12 Observations 3061267 Correlation stDev 0.27 Bg Correlation 0.009 Bg Correlation stDev 0.12 P-value 1.2e-287 M-W statistics -32 Parameters Name Value step 100 strand 1 wSize 200000 wStep 200000 noiseLevel 0.0 flankSize 0 kernelSigma 2000 threshold 0; kernelType NORMAL maxNA 99 maxZero 99 nShuffle 30 pVal 0 qVal 0 Rscrpit 1 Distances DETAIL OutChrom 1 chrom cc count All 0.07 349088 chr1 0.07 349088 chr2 0.07 349088 chr3 0.07 349088 chr4 0.07 349088 chr5 0.07 349088 chr6 0.07 349088 chr7 0.07 349088 chr8 0.07 349088 chr9 0.07 349088 chr10 0.07 349088 chr11 0.07 349088 chr12 0.07 349088 chr13 0.07 349088 chr14 0.07 349088 chr15 0.07 349088 chr16 0.07 349088 chr17 0.07 349088 chr18 0.07 349088 chr19 0.07 349088 chr20 0.07 349088 chr21 0.07 349088 chr22 0.07 349088 chrX 0.07 349088 chrY 0.07 349088